В рамках проекта НРУ-2025 проведена оценка деятельности 389 университетов России. В рейтинг включены все статусные университеты страны: 29 национальных исследовательских университетов, 10 федеральных, 33 опорных, а также 145 университетов, участвующих в программе "Приоритет 2030". Кроме того, оценена деятельность 22 негосударственных вузов.

Деятельность университетов оценивалась по шести параметрам: Бренд, Образование, Исследования, Социальная среда, Сотрудничество, Инновации и Предпринимательство.

 В ТОП-10 лучших университетов России вошли: Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, Национальный исследовательский ядерный университет "МИФИ", Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), Национальный исследовательский университет "Высшая школа экономики", Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Национальный исследовательский Томский государственный университет, Санкт-Петербургский государственный университет, Казанский (Приволжский) федеральный университет, Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б. Н. Ельцина и Национальный исследовательский технологический университет "МИСИС".

Оценка проводилась на основании обработки данных анкет, представленных университетами, доступных публичных данных, размещаемых учебными заведениями на своих веб-сайтах, публичных данных информационных ресурсов Министерства науки и высшего образования РФ, а также информации из информационно-аналитических систем "СПАРК-Интерфакс" и "СКАН-Интерфакс".

Все параметрические и сводная оценки приводятся к безразмерной 1000-балльной шкале; университеты ранжируются по убыванию величины оценки. Следует подчеркнуть, что Сводный рейтинг представляет собой арифметический результат шести параметрических рейтингов.

Проект Национальный рейтинг университетов реализуется Группой "Интерфакс" с 2010 года. Результаты рейтинга учитываются при формировании Национального агрегированного рейтинга.